en de manieren waarop de infectie zich verspreidt kunnen verschillen.De kolonisatie die wordt gemedieerd door ziekteverwekkers kan in feite plaatsvinden door:
- Opstijgende route vanuit de blaas (de meest voorkomende): vanuit het perineum (of vanuit de vaginale vestibule, in het geval van vrouwelijke patiënten), gaan de micro-organismen omhoog in de urethra, dan in de blaas, tot aan de nier; de belangrijkste oorzaken van infectie voor vrouwen bestaat uit de vervorming van de urethra tijdens geslachtsgemeenschap, terwijl het bij mannen vaak secundair is aan prostatitis. Bij gekatheteriseerde patiënten kan besmetting optreden na het plaatsen of manipuleren van de katheter, met als gevolg mogelijke opstijging van ziekteverwekkers in de blaas .
- Bloedaflopende route: via de bloedbaan, in de loop van bloedvergiftiging, bereiken de ziekteverwekkers de nier en veroorzaken nefritis en nierabcessen.
- Aflopende lymfebaan: een netwerk van lymfevaten verbindt de stijgende dikke darm met de rechter nier en de dalende dikke darm met de linker nier.
De micro-organismen die betrokken zijn bij pyelonefritis zijn meestal dezelfde verantwoordelijk voor infecties van de urinewegen, van de geslachtsorganen en het maagdarmkanaal, dus in de blaas, prostaat, baarmoederhals, vagina, urethra of rectum: Escherichia coli, Klebsiella spp., Proteus soorten., Enterococcus spp. enzovoort.
In de meeste gevallen vertegenwoordigen deze pathogenen de bacteriën van de fecale flora, die de stijgende route nemen, hoewel in het algemeen peristaltiek (bewegingen van samentrekkingen en uitzetting van de wanden van de urinewegen) een "effectieve beschermende werking tegen infecties heeft".
Andere ongebruikelijke micro-organismen worden af en toe gemeld: mycobacteriën, gisten en schimmels, evenals opportunistische pathogenen zoals Corynebacterium urealyticum.
