Het is belangrijk om acute en chronische diarree te onderscheiden, het probleem in de dunne of dikke darm te lokaliseren en te begrijpen of de diarree het gevolg is van een primaire gastro-intestinale aandoening of dat het een gevolg is van een extra-intestinale aandoening.
Gezien de verschillende oorzaken van diarree en de mogelijk zelfbeperkende aard ervan, moet de diagnostische benadering variëren afhankelijk van de klinische geschiedenis van de patiënt, de ernst van de symptomen en de beschikbaarheid van de eigenaar.
zijn de meest voorkomende oorzaken. In deze gevallen is de anamnese erg belangrijk (contact met zieke dieren, bekende intoleranties, verblijf in kennels, consumptie van onvoldoende verhit of bedorven voedsel) De aanwezigheid van slijm, levend bloed, moeite en urgentie bij het poepen zijn indicatief voor een dikkedarmprobleem , terwijl gewichtsverlies en verteerd bloed wijzen op betrokkenheid van de dunne darm.
Voor dieren met milde diarree, normale voedsel- en waterconsumptie, geen braken of uitdroging, is ondersteunende zorg vaak voldoende. In geval van progressie van klinische symptomen, met uitdroging en verlies van eetlust, zijn aanvullende diagnostische tests zoals ontlastingstests, tests op infectieziekten en bloedtesten noodzakelijk, met bijzondere aandacht voor dieren met tekenen van systemische ziekten.
Diarree bij gezelschapsdieren is in verband gebracht met Clostridium perfringens, Clostridium difficile, Campylobacter, Salmonella en E. coli. Aan de andere kant herbergen veel gezonde dieren deze bacteriën, en hun bevinding impliceert niet noodzakelijk de aanwezigheid van klinische symptomen.
Er is met name een duidelijke correlatie tussen C. perfringens en acute hemorragische diarree, maar het is niet duidelijk of de aanwezigheid van deze bacterie de oorzaak of het gevolg is, vanwege een "verandering in de darmmicroflora; hetzelfde geldt voor C. moeilijk.
Campylobacter daarentegen kan gastro-intestinale symptomen veroorzaken, vooral bij jonge dieren die worden blootgesteld aan predisponerende factoren zoals stress, overbevolking en bijkomende ziekten.
Sommige soorten E coli kan darminfecties veroorzaken bij honden met een verminderd immuunsysteem en zijn vaak betrokken bij Boxer granulomateuze colitis, met soortgelijke laesies die ook worden beschreven bij de Franse Bulldog en Border collie.