De normale functie van calprotectine is daarom het tegengaan van de ontwikkeling van bacteriën en schimmels in het lichaam (antimicrobiële activiteit).
In aanwezigheid van een "ontsteking in het maagdarmkanaal migreren de witte bloedcellen ernaar en geven het eiwit af, waarvan de concentratie in de ontlasting dienovereenkomstig toeneemt.
Om deze reden kan calprotectine worden gebruikt als een indicator van ontsteking bij chronische darmziekten, sommige infecties van bacteriële oorsprong of kankers van het spijsverteringsstelsel.
De fecale dosering van calprotectine is de enige test die informatie kan geven over de plaats van de ontsteking. De bepaling van de parameter in het plasma benadrukt daarentegen een ontstekingstoestand die overal kan worden gelokaliseerd. Bovendien is bij patiënten met chronische inflammatoire darmaandoeningen (zoals colitis ulcerosa en de ziekte van Crohn) de dosering van fecaal calprotectine een geldige index van de mate van ontsteking.
; aanwezig in alle delen van het menselijk lichaam, is het voornamelijk geconcentreerd in het cytoplasma van neutrofiele granulocyten.In lagere concentraties is calprotectine ook aanwezig in monocyten en in de daaruit afgeleide macrofagen; deze cellen, vergelijkbaar met neutrofielen, zijn witte bloedcellen die zijn ontworpen om te fagocyteren - en dus om te omhullen, verteren en vernietigen - vreemde deeltjes die het organisme zijn binnengedrongen, inclusief micro-organismen (waartegen neutrofielen actiever zijn).
Zowel neutrofielen als macrofagen hebben het vermogen om chemische mediatoren van de ontstekingsreactie af te scheiden.
Binnen deze immuuncellen vertoont calprotectine een hoge bacteriostatische en mycostatische activiteit; als zodanig gaat het effectief de groei van schimmels en bacteriën tegen.